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行政部
行政部下设人力资源办公室、宣传办公室、综合管理办公室，立足团队建设、内部管理、对外宣传、制度管理、服务保障，为各项工作高效运转提供支撑。
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财务部
负责研究院各项经费的收支管理；负责财务预算、财务核算及财务报表编制；负责组织财经法律、法规的贯彻落实；协助项目申报、企业调研等工作。
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培训部
培训部依托北京大学及国内外丰富的智力资源，致力于本地区优秀人才的引进、培育和可持续发展。同时针对各类组织的规划和管理需要，定制个性化解决方案。
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项目管理与技术合作部
项目管理与技术合作部负责技术研发、成果转化和技术服务；科研项目管理、研发中心与产业基地的建设管理；专家库、项目库、成果库、政策库的建设管理等。
